Salvando o mamute extinto… restaurando com sucesso a estrutura tridimensional do genoma e do cromossomo

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Recuperado de amostras antigas de DNA

Amostra de carcaça de mamute lanoso / Imagem = Universidade de Estocolmo

Poderíamos ver um mamute, um mamífero com formato semelhante a um elefante que existiu de cerca de 4,8 milhões de anos atrás a cerca de 4.000 anos atrás?

Como os mamutes são frequentemente deixados em estado mumificado, eles são os animais para os quais a pesquisa de restauração é mais ativa. Entretanto, uma equipa de investigação internacional conjunta composta por investigadores de 33 universidades e institutos de investigação em seis países: Dinamarca, Estados Unidos, Espanha, Suécia, Rússia e Austrália está a utilizar amostras de ADN antigas para recuperar a estrutura tridimensional do genoma e dos cromossomas. . O mamute de 52 mil anos foi declarado bem-sucedido no dia 13 (horário local).

Este estudo incluiu a Universidade de Copenhague na Dinamarca, o Baylor College of Medicine nos Estados Unidos, a Rice University, o University of Nebraska Medical Center, a Northeastern University, a Texas Southern University, o Massachusetts Institute of Technology (MIT)-Harvard Broad Institute e o Universidade da Califórnia Santa Cruz. Cruz (Universidade da Califórnia em Santa Cruz), Oregon Health & Science University, Universidade de Illinois Urbana-Champaign, Universidade da Califórnia em Irvine, Zoológico de San Antonio no Texas, Zoológico de Houston, Harvard Medical School, Instituto de Tecnologia de Massachusetts, Centro Nacional Espanhol para Análise do Genoma, Universidade Livre de Barcelona, ​​​​Instituto de Ciência e Tecnologia de Barcelona, ​​Centro Sueco de Paleontologia, Museu Sueco de História Natural, Estocolmo Biólogos e cientistas médicos do Instituto SB RAS de Biologia Molecular e Celular da Rússia, Instituto SB RAS de Células e Genética, Academia de Ciências da República de Sakha. A Northeastern Federal University, a University of Western Australia na Austrália e o NTNU University Museum na Noruega participaram da exposição. Este estudo foi publicado na edição de 12 de julho da Cell, uma revista acadêmica internacional na área de biologia.

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Embora a estrutura tridimensional do genoma forneça muitas informações, as amostras antigas de DNA consistem em fragmentos muito pequenos e curtos. Assim, a equipe de pesquisa tentou montar o genoma antigo a partir de amostras antigas de DNA, desenhando um mapa 3D do genoma humano.

A equipe de pesquisa examinou dezenas de espécimes de mamute ao longo de cinco anos e encontrou um espécime excepcionalmente bem preservado no nordeste da Sibéria em 2018. A equipe de pesquisa coletou DNA da pele atrás das orelhas do mamute para reconstruir a estrutura do genoma do mamute. A interação dos fragmentos de DNA foi analisada usando um método de mapeamento denominado Hi-C. A equipe de pesquisa combinou as informações físicas obtidas na análise Hi-C com o sequenciamento de DNA para determinar com precisão a fração de DNA em interação. Em seguida, o mapa do genoma do mamute foi reconstruído usando o genoma do elefante existente como estrutura (modelo).

Como resultado, foi confirmado que o mamute tinha os mesmos 28 cromossomos que os elefantes asiáticos e africanos existentes. No entanto, as células da pele do mamute têm um padrão de ativação genética diferente do dos seus parentes mais próximos, as células da pele do elefante asiático, que parecem ser genes ligados à pele do mamute e à tolerância ao frio.

A equipe de pesquisa espera que o método utilizado desta vez possa ser usado não apenas para recuperar mamutes, mas também para estudar e restaurar múmias egípcias antigas.

Enquanto isso, Olga Dudchenko, professora de genética do Baylor College of Medicine, nos EUA, que liderou a pesquisa, disse: “Este estudo mostra que o Hi-C pode fornecer uma imagem aproximada de tudo com apenas um pedaço de DNA extraído de um gene.” “Múmia ou fóssil.”

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Jang Ji-min, repórter convidado do Hankyung.com newsinfo@hankyung.com

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